帕加尼 Zonda 擁有眾多獨特的設計元素。

首先是楔形的車鼻和水滴狀的玻璃車廂，這一設計不僅造型優美，還與 GT 耐力賽車型神似。

其次，車尾擾流板中央一分為二，設計特別且美感十足，如同噴氣式飛機的車尾排氣管更是其注冊商標。

再者，深下頷進氣壩、車尾擾流板和氣流擴散器的組合，能在高速時為車身產生 500 公斤下壓力，確保車身穩定。

內飾方面，大量采用碳纖維材質、真皮和航空鈦合金，中控區的面板材質是航空鈦合金，科技感拉滿。

在車身設計上，整體車型比重均勻，經過風洞測試。從第一款車型 Zonda C12 開始，其車身設計靈感來源于奔馳 C 組別的銀箭賽車，抓住“風”的元素，實現藝術與科技結合。

Zonda R 是專為賽道設計，基于 Zonda F 建造，采用碳鈦單體 F 底盤，大量應用鈦和碳，擁有更長軸距、更輕盈車身、更強動力。空氣動力學套件在極速 350 公里下可提供最高 1500 公斤下壓力，車身后部的空氣動力學效應與全新前蓋、封閉式車底、尾部擴散器等部件共同作用。

早期 Zonda 由 F1 冠軍范吉奧參與設計，最初命名“Fangio F1”，后改名為 Zonda 以表敬意。