汽車燒甲醇對發動機的影響主要有以下幾個方面。

一是車輛零件腐蝕。甲醇汽油具有腐蝕性，不是特定的甲醇汽車，長期使用會腐蝕發動機相關部件，降低耐用性和穩定性。

二是動力性能下降。甲醇汽油燃燒熱值不高，普通燃油車加注后發動機熱效率下降，車輛動力性能降低，冬季低溫環境更明顯。

三是油耗增加。動力輸出下降，為獲得足夠動力需增加踩油門次數和深度，從而增加油耗。

不過，甲醇發動機也有優點。比如排放與環保方面，相對傳統汽油內燃機更清潔，基本只排放二氧化碳和水，少量一氧化碳，環保程度高。燃油經濟性好，雖燃燒熱值不高需更多燃料，但甲醇燃料價格低廉，綜合燃油經濟性不錯。安全性高，蒸汽壓和揮發性低，蒸汽比例高，發動機起火、爆燃等危險可能性降低。

但甲醇發動機也有缺點。像一些特定的甲醇發動機，只能加注指定牌號的甲醇汽油，我國甲醇汽油加氣站普及率低，供能有限。而且長期使用后，發動機的氣密性會下降，可能導致甲醇汽油泄漏。使用甲醇汽油還可能出現點火困難、加速乏力、油封漏油、油泵損壞、油路堵塞等故障。故障原因包括油箱臟有膠質沉積、油箱有水造成油品分層、所用材料材質不適合甲醇汽油、車輛零部件老化等。

使用甲醇汽油前應仔細清除油箱等部件的膠質、水分和污垢，初次使用或推廣市場建議小比例運作。車輛首次加注甲醇汽油，行駛 3 萬公里以上車輛最好清洗油箱。經常使用甲醇汽油的車輛建議添加防腐蝕劑，不要長期停放。低比例甲醇汽油不會增加油耗，最佳比例是 15%，最優化情況下最高比例是 30%。