本田新飛度的保養成本因車型和保養項目有所不同。保養周期一般為 5000 公里。

換機油機濾的小保養，機油 248 元，濾芯 39 元，工時 110 元，差不多 400 元。最貴的保養大概 2000 元左右。

原廠機油有 SW 級 5W-30 半合成機油和 SM 級 5W-40 全合成機油可選，價格分別為 188 元/4 升和 388 元/4 升。飛度保養只換機油機濾，費用約 400 元。

空氣濾芯和空調濾芯更換周期不同，前者約 2 萬公里，后者約 1 萬公里。

汽油泵價格和更換工時費較貴，其他配件相對便宜。

以飛度 2023 款 1.5L CVT 潮享版為例，一年保險費 3450 元，包含交強險、車船稅和基礎商業險。一年燃油費 8733 元，綜合油耗 5.57L/100km，需加注 95 號汽油。一年保養費用 2060 元左右，6 萬公里保養費用 6180 元。綜合來看，飛度一年（2 萬公里）的使用成本大概在 14243 元，均攤到每月在 1187 元上下。