比亞迪 S6 的安全配置很豐富。

它在主動安全方面表現出色，制動系統采用博世 ABS+EBD 以及博世四輪碟剎，能在惡劣路況下保持出色的穩定性和操控性。還有先進的全方位倒車雷達系統、彩色顯距倒車影像監視系統以及右前輪盲區可視系統。

此外，Can-Bus 電子智能管家系統能讓發動機、變速箱等各系統協調運作，保障操控性和安全性。

被動安全方面，比亞迪 S6 車身采用承載式結構，四門及前后裝配有防撞鋼梁，側圍采用一體式沖壓側圍，再加上 3H 高強度全方位碰撞吸能車身結構設計，有效降低駕乘人員在碰撞時受到的傷害。

車內配備全方位六安全氣囊配合預緊限力式安全帶，三段式潰縮吸能轉向柱能在事故發生時自動潰縮保障駕駛員安全。

對于兒童安全，全車系配置了統一標準的兒童安全座椅固定裝置，后排車門具有兒童安全門鎖功能，車窗也有主駕駛開關設定功能。

在中國汽車技術研究中心公布的 2011 年第四批 C-NCAP 碰撞試驗成績中，比亞迪 S6 憑借卓越的主被動安全性能獲得五星安全評級，成為中國首款五星安全 SUV 車型。