邁巴赫 S650 的安全配置非常豐富。

首先是防盜報警系統，當汽車出現非法啟動、開門振動、系統被破壞等警情時，系統會立即撥打車主預設的報警電話，并聲光警示、鎖斷電路和油路，讓車在未解警時無法啟動。在遭遇搶劫或搶車時，車主按下隱蔽按鈕，系統能撥打預設緊急求助電話，接警電話還能對被劫車輛進行反控停車、監聽、喊話等操作。

其次，車輛配備了自適應制動技術。在采取緊急制動時，剎車燈會自動爆閃，警示后車保持安全車距。車速較高時緊急制動，不僅剎車燈爆閃，車輛停止后危險警告燈會自動打開，防止二次碰撞，若無危險，車輛恢復正常行駛且速度超過 10km/h 后危險警告燈自動關閉。

再者，盲點輔助和并道輔助系統能夠幫助駕駛者在變道時更加安全，避免因視線盲區導致的事故。后排碰撞保護能為后排乘客提供額外的安全保障。剎車輔助和雷達測距系統可以輔助駕駛者更好地控制剎車距離。還有主動轉向輔助系統，能在行駛中提供轉向支持。

環影和 LED 大燈、遠光燈輔助、夜視輔助等配置，讓駕駛者在各種環境下都能有清晰的視野，提升行車安全性。電吸門的配置在車門未關好時會自動吸合，確保車門關閉牢固。