奧迪 Q2 的變速箱主要有兩種類型，分別是 7 速干式雙離合變速箱和 6 速手動變速箱。

7 速干式雙離合變速箱常見于奧迪 Q2 車型，如奧迪 A3 家族全系列使用的 DQ200 7 速干式雙離合變速箱，奧迪 Q2 同樣采用。這種變速箱在大眾集團旗下的低排量車型中較為常見，例如搭載 1.4T 低排量發動機的車型。其優勢在于具有一定的傳動效率和換擋速度。

6 速手動變速箱則給駕駛者提供了更多的操控樂趣和自主性。

在駕駛奧迪 Q2 時，如果選擇自動擋，要注意不同路況的檔位選擇。上坡時，需要較大動力可用“D-”減檔獲得高扭矩爬坡，動力充足可用“D+”升檔防止動力浪費。下坡時，建議用“D+”升檔，緩坡用 3 檔，陡坡用 2 檔，大陡坡用 1 檔。若車輛在下坡時溜得太快，要進行減檔操作。在“D”檔位置將檔桿往右推可切換到手動模式，檔把上移升檔，下拉降檔。