本田宗一郎有諸多獨特的經營理念。

他充分尊重個人，在經營中公平合理地分配權力。例如在東海精機時期就善于與不同類型的人共事，在本田技研期間與藤澤武夫分工明確，分別負責技術產品和銷售經營。

他禁止領導親屬加入公司，以確保權力傳遞給有能力者，且公司中途聘用的員工占比高，保持了創造力。公司內無論級別高低，員工都被稱呼為“先生”，董事采用同室辦公制度。

他強調“為自己工作”，重視個人，人事安排和調動遵循“自我申請制”。本田宗一郎倡導自由競爭，實行一人一事，鼓勵不同性質的競爭以達成共同目標。

在組織結構上實現“鎮紙型組織”，研究人員可自由選擇專攻方向，課題采納后以提案人為中心組建團隊，通過競爭爭奪成果。

他非常注重客戶滿意度，認為本田的研究人員是在研究人類心理，竭盡全力滿足人類需求。本田領導者強調客戶滿意度第一，開發部門人員都是市場調研員，用自身感受探索市場趨勢。

他還注重信任的培育，認為企業要有靈敏的情報收集能力，信任是無法抹去的，是一個人的簡歷。他指出研究所是研究產品而非制造博士，商品裝飾應注重實用性，信用和金錢是人生杠桿，要為自己的幸福工作，轉敗為勝在于追查失敗原因，管理者要具備智慧、仁慈和勇敢，有夢想比背誦兵法更有效。