車輛有違章未處理不能申領免檢車檢驗標志。

依據相關規定，在車輛檢驗有效期滿前申請檢驗合格標志時，如果存在交通違法行為未處理，必須先處理完畢才能進行申請。

比如，公安部的業務辦理系統在核發車輛檢驗合格標志業務時，要求車輛的道路交通安全違法行為和交通事故必須處理完。

同時，《機動車登記規定》也明確指出，機動車所有人在申請檢驗合格標志前，應當將涉及該車的道路交通安全違法行為和交通事故處理完畢。

法律依據為《道路交通安全法》等相關法律法規。

另外，在年檢之前，車輛違章需要全部處理。如果機動車違章記錄未處理完，將無法參加年檢，即便通過車輛外檢，交管部門也不會核發檢驗合格證明。

所以，為了順利申領免檢車檢驗標志和通過年檢，一定要提前處理好車輛的違章。