無卡 ETC 存在一些弊端。

車主負擔會加重，因為無法享受 ETC 卡的優惠，每次通行需支付高額費用，增加經濟負擔和道路擁堵風險。

車輛管理難度大，僅靠車牌識別，車牌易偽造，車主可能借此逃避交通違法處罰和不繳停車費，給交通管理帶來損失和車主不便。

隱私泄漏風險高，通過掃描車牌辨識，不法分子易獲取車主隱私信息，威脅財產和生命安全。

缺乏交通信息互動，不能像有卡 ETC 那樣提供路況、天氣、違章等信息，影響車主掌握車輛行駛情況和操作。

司機認證困難，無法對駕駛員身份認證，所有人能用同一車牌繳費，易導致不正當競爭和車輛盜竊難預防。

無法與其他系統互聯，相關部門不能及時了解交通擁堵情況，降低管理效率，也不能與其他便民服務互聯，影響城市運行效率和服務質量。

后期管理成本高，車輛管理和修改車牌號碼需后期處理，設備故障或廢棄不能重復使用，要重新購買安裝。

缺乏發票開具功能，不能給專業貨運公司提供發票，增加企業經濟負擔和稅收難題。

不過，無卡 ETC 也有優點，比如節約時間成本，辦理符合國家發展趨勢有政策支持能節省開支。但目前技術還不夠成熟，有待完善，比如聯網方面，網絡信號不好可能導致交易失敗認證不通過。