豐田MR2有以下獨特的設計特點：

1. 中置引擎、后輪驅動、雙座布局：這種布局為車輛提供了出色的操控性能和平衡感。

2. 輕量化設計：初代日版車型車重僅950公斤，美版車型車重也較輕，有助于提升車輛的性能和燃油經濟性。

3. 外觀設計：初代采用跳燈設計，整體風格硬朗運動；第二代線條圓潤，被稱為“平民法拉利”；第三代借鑒了保時捷Boxster的外觀，偏向玩樂風格。

4. 動力系統：初代的4A-GE發動機由蓮花汽車提供技術調校，還有渦輪增壓版；第二代采用更先進的3S-GE系列發動機，并針對不同市場進行動力調校；第三代使用1ZZ-FE發動機，動力表現不佳。

5. 靜音設計：在機箱方面，金河田靜音坊MR2機箱搭載多處靜音棉并預裝了3把靜音風扇，能有效隔斷噪音。

6. 散熱設計：多方位散熱，保障機箱內的熱氣流定向走勢，規律排出，增加散熱效率。

7. 結構設計：采用寬厚的五金結構，具有良好的兼容性，能搭載多種硬件。

8. 豐富接口：在音頻設備方面，MR2有大量輸入輸出接口，包括USB2.0/USB3.0接口、專用電源接口、耳機輸出接口、線路輸出、光纖輸出、TF卡插槽、HDMI輸出等，體現了其多用途特性。

9. 操控調校：初代MR2的懸掛和操控由蓮花汽車調校，保障了操控性和駕駛樂趣。