H2R 的生產工藝難點不少。

首先是引擎方面，要讓一臺 998cc 的直列四缸引擎產生 300 匹馬力，這對發動機的制作工藝要求極高。為實現如此強大的動力輸出，川崎采用了航空航天部門的技術，配備行星齒輪從曲軸傳遞動力，以驅動葉輪達到超高轉速。同時，還得確保發動機內部能承受高轉速運行。

其次，空氣動力學設計也是難點。H2R 的外觀由航空航天部門設計，傾斜的碳纖維定風翼取代傳統后視鏡，能平滑翼尖周圍氣流產生下壓力。高剛性碳纖維整流罩和下巴擾流板也需精準設計以有效引導氣流、減少阻力并增加穩定性。

再者，配置和電控方面要求嚴格。頂級的 Brembo 剎車卡鉗、離合器，KYB 倒立式前叉，Ohlins TTX36 后減震，博世 6 軸 IMU，以及各種控制模式和系統，都需要精細制造和調試。

還有，自修復面漆的應用也有難度。要讓面漆能在一定時間內自行修復劃痕，需要特殊的材料和工藝。

另外，純手工打造全車，使用碳纖材料制作車頭、車殼、車翼等部件，既考驗工藝水平，也對成本和生產效率有影響。