如果不及時處理摩托車駕照扣12分，會產生諸多不良后果。首先，這會對考駕照產生影響，交通管理部門在審核申請人資格和記錄時，一旦發現存在未處理的嚴重交通違法情況，駕照考試進程可能受阻，甚至無法取得駕駛證。其次，后續處理流程較為復雜，未吊銷或注銷時要參加學習和考試，若已吊銷或注銷則需重新申請。因此，摩托車駕照扣12分后應盡快處理，避免不必要的麻煩。

具體而言，當摩托車駕照被扣滿12分卻未及時處理時，若你正打算考取其他類型的駕照，比如汽車駕照，交通管理系統會清晰地顯示出你存在未處理的違章扣分情況。這種情況下，相關部門很可能不會批準你新駕照的申請流程，使得你獲取新駕照的計劃被迫擱置。

在后續處理流程上，如果駕駛證尚未被吊銷或注銷，你需要盡快前往交管部門。在那里，你要開啟為期七日的學習之旅，系統且全面地學習交通法規知識。學習結束后，還需參加考試，只有考試合格，記分才會被清除，駕駛證才能重新回到你手中；要是考試不合格，那就得繼續學習和考試，直到通過為止。

而要是駕駛證已經被吊銷或注銷，重新申請駕駛證就需要嚴格滿足年齡、身體等各方面條件，同時認真準備并提交一系列證明文件。之后，還得參加并順利通過相應的考試，整個過程相對繁瑣。

總之，摩托車駕照扣12分后不及時處理，會在考駕照方面設置障礙，還會帶來復雜的后續處理工作。為了自身出行便利以及駕照的順利獲取和正常使用，一旦出現這種情況，務必盡快前往相關部門依規處理，以免遭受更多困擾。