在 4S 店更換后擋風玻璃和在維修店更換主要區別在于，4S 店配件質量和售后有保障但價格高，維修店價格實惠但需謹慎選擇。4S 店通常采用原廠配件，安裝工藝更專業，售后服務也更完善，能讓車主更放心。而維修店雖可能提供價格優勢，也有技術不錯的，但市場參差不齊，若選擇不當可能遭遇配件質量不佳等問題。

從配件質量來看，4S 店有著明顯優勢。它們直接與汽車廠家合作，配件供應渠道正規，所使用的后擋風玻璃基本都是原廠出品，無論是玻璃的材質、規格還是光學性能等方面，都與車輛原配的高度契合，能最大程度保障車輛的原有品質和安全性。相比之下，維修店的配件來源較為復雜，雖然部分大型正規維修店也能提供質量不錯的配件，甚至有些就是知名品牌玻璃供應商提供的產品，但不可否認，一些小維修店為了壓縮成本，可能會采用質量參差不齊的玻璃，這無疑給車輛的安全埋下了隱患。

安裝工藝方面，4S 店經過廠家專業培訓的技術人員，對車輛的結構和玻璃安裝要求更為熟悉，嚴格按照標準流程操作，確保玻璃安裝得牢固且密封良好，降低后期出現漏水、異響等問題的概率。維修店的技術水平則存在較大差異，技術精湛、經驗豐富的師傅能保證安裝質量，但一些缺乏專業培訓的人員可能在安裝過程中出現失誤，影響玻璃的安裝效果。

售后保障上，4S 店通常能提供更完善的服務。在質保期內，如果后擋風玻璃出現質量問題或安裝導致的故障，4S 店會負責免費維修或更換。而維修店的售后政策可能各不相同，有些售后保障力度較小，甚至可能出現推諉責任的情況。

總之，在決定去哪里更換后擋風玻璃時，車主應綜合自身的實際情況。若追求配件質量、專業安裝工藝和完善售后，且預算充足，4S 店是不錯的選擇；若預算有限，且能找到信譽良好、技術可靠的維修店，維修店也可以考慮。