公司車輛有多個違章，處理時沒有嚴格的先后順序要求。不同的違章情況可靈活處理，若是性質相同的違章，可一并前往交通管理部門處理；若性質不同，優先處理較緊急或影響大的。也能按照違章時間先后處理，或者為保留分數應對未來違章，優先處理低分違章。總之，可依實際需求來選擇處理順序，確保在規定時間內完成處理即可。

在處理公司車輛多個違章時，還有一些細節需要注意。如果是同一員工產生的多個違章，在證件齊全的情況下，可選擇集中處理。比如，準備好駕駛證、行駛證以及身份證，前往當地交通管理部門的違章處理窗口，工作人員會核實證件信息，確認違章事實后開具處罰決定書，后續按要求繳納罰款就行。

要是不同員工導致的違章，如今可以通過交管12123APP來便捷操作。一輛公司車最多能綁定三個駕駛證，一個駕駛證也最多綁定三輛車，在車管所或APP上都能辦理綁定。綁定成功后，違章處理人下載登錄APP，首次綁定機動車，查詢違章，選擇未處理違規“處理并支付”，再選擇支付方式完成支付。

另外，處理違章要區分現場違章和電子眼抓拍違章。現場違章執法必須在15日內到指定地點繳納罰款；電子違章則應在確認違章信息后15日內繳納罰款，電子違章通知書30天內確認，不過實際上在車輛年審前確認也可以。

總之，公司車輛多個違章處理順序靈活多樣。但無論選擇何種順序，都要保證證件齊全，及時確認違章信息并在規定期限內繳納罰款，避免產生滯納金影響公司車輛正常使用，也要注意按規定完成扣分處理，保障駕駛證記分周期的正常流轉 。