要確保二手車買賣協議書合法，需從多方面著手。首先協議雙方要具備相應民事行為能力，自然人需是完全民事行為能力人，法人等要在核準經營范圍內交易；意思表示應真實，不存在欺詐、脅迫等情況。再者，內容要合法合規，不違背法律法規強制規定與公序良俗，不損害各方利益。同時，協議要明確雙方信息、車輛詳情、交易價格、支付方式等關鍵內容。此外，完成交易后還應及時辦理過戶登記 。

在明確雙方的民事行為能力與意思表示真實性后，協議內容的具體條款設置至關重要。詳細寫清雙方基本信息，能避免后續出現身份不明的糾紛。對于車輛基本情況，諸如車型、車況、車輛識別號碼等都要精準描述，這是交易的核心標的，不可模糊。

交易價格、支付期限、地點和方式，都應該白紙黑字清晰呈現。比如支付方式，是現金、轉賬還是分期，分期的具體時間節點等都需明確。明確交易風險、雙方責任、權利義務更是保障交易公平公正的關鍵。例如，接車前后雙方對費用、債權、債務、事故的責任劃分，這樣一旦出現問題，就能依據協議快速判定責任歸屬。

違約責任和爭議解決辦法也不可或缺。詳細規定若一方違約應承擔怎樣的后果，以及雙方在產生爭議時，是選擇協商、仲裁還是訴訟等方式解決，為可能出現的矛盾提供解決路徑。合同生效日期也需要明確，讓雙方清楚知曉協議何時開始具備法律效力。

完成交易后，及時辦理過戶登記是極為重要的一環。已注冊登記機動車所有權轉移且原、現機動車所有人在同一車輛管理所管轄區的，現機動車所有人應于所有權轉移之日起三十日內申請過戶登記并交驗車輛。這不僅是保障雙方權益的必要操作，也能避免后續因車輛所有權問題引發諸多麻煩。總之，從協議簽訂到過戶登記，每一個環節都緊密相連，共同保障二手車買賣協議書的合法性與有效性，讓交易雙方的權益都能得到充分的保護 。