新能源車船稅滯納金計算方法和普通車船是一樣的。車船稅滯納金通常按照每日萬分之五的比例計算，公式為滯納金 = 欠繳金額 × 0.05% × 欠繳天數。不論新能源車還是普通車船，只要出現逾期繳納車船稅的情況，都是依據這一公式來計算滯納金。這種統一的計算方式，保證了稅收政策在執行上的一致性與公平性 。

在實際情況中，欠繳金額的確定對于新能源車和普通車船而言，有著各自不同的依據。普通車船的應納稅額，會根據車船類型有所不同。乘人汽車應納稅額是應稅車輛數量乘以適用年稅額；載貨汽車和機動船是自重位數乘以適用年稅額；船舶則是凈噸位數乘以適用年稅額；新購置的普通車船購置當年應納稅額 =(年應納稅額 / 12)*應納稅月份數。而新能源車中，純電動商用車、插電式（含增程式）混合動力汽車、燃料電池商用車符合條件的免征車船稅，純電動乘用車和燃料電池乘用車不在征稅范圍。不過，如果不符合免稅條件或超出免稅范圍的新能源車，應納稅額也有相應規定，自 2024 年 7 月 1 日起，享受車船稅優惠的新能源車有新的技術標準 。

欠繳天數的計算，對于兩者來說規則是統一的。都是從稅款繳納期限屆滿次日開始計算，一直算到實際繳納稅款的當天。比如車船稅繳納期限是每年 1 月 1 日至 12 月 31 日，若車主在次年 1 月 15 日繳納，那么滯納天數就是從次年 1 月 1 日算至 1 月 15 日，共計 15 天。

總之，新能源車船稅滯納金和普通車船稅滯納金在計算比例和天數的規則上是一致的。盡管不同類型的車船在應納稅額的計算依據上有所差異，但在滯納金的計算方式上保持統一，這既體現了稅收制度的規范，也維護了稅收公平的原則，讓所有納稅人在相同的規則下履行納稅義務。