不同機構出具的二手車評估報告存在差異。二手車評估價格受品牌保值率、車齡、行駛里程、車況、配置等諸多因素影響，不同品牌在這些因素上的體現和權重有別。同時，各評估機構因技術力量、經驗、設備等條件不同，評估的側重點和方式也會不同。比如大型專業評估機構可能給出精準全面的評估，小型機構則可能存在局限，種種因素綜合起來，使得評估報告出現差異 。

從品牌保值率角度來看，日系等主流品牌市場認可度高，保值率通常也高，評估價格相對可觀；而一些冷門品牌市場接受度低，舊車價格會大幅降低。比如一輛三年車齡的日系熱門車型，和同等條件下的冷門品牌車型相比，評估價格會有較大差距。

車齡和行駛里程對不同品牌舊車價格影響也不一樣。豪華品牌新車價格高、技術更新快，前期折舊率可能較大；經濟實用型品牌折舊曲線相對平緩，舊車價格波動較小。車況對于評估價格影響同樣關鍵，技術含量高、維修成本大的品牌，核心部件狀況對價格影響極大；常見家用品牌在車況方面的容錯率相對較高。配置方面，30萬元以內車型，常見品牌高低配差價不太明顯，高端品牌配置差異對價格影響則較為顯著。

另外，不同類型的評估機構，其評估報告也會有差異。二手車交易市場內的評估機構，因身處市場，對市場行情較為熟悉，但可能受市場利益關系影響；私人評估師的評估可能更依賴個人經驗和專業水平；汽車制造商或其授權經銷商的評估，可能會側重于品牌相關因素；保險公司的評估則多從車輛風險角度出發。

總之，不同機構出具的二手車評估報告存在差異是多種因素共同作用的結果。在進行二手車交易時，車主為獲取更合理準確的評估，應多了解市場行情，選擇專業、信譽好的評估機構，也可參考多個評估報告，綜合考量后再做決策 。