兩腳離合器的工作原理是這樣的。

加擋時，因為加擋前要沖車提高發動機轉速，所以第一次踩下離合器踏板，把變速桿掛入空檔，然后左腳再踩下離合器踏板，同步將變速桿掛入高一級檔位。這是因為變速箱的第一軸和中間軸的轉速比第二軸快很多，抬起離合器踏板能利用發動機怠速的牽阻作用降低第一軸和中間軸的轉速。當發動機聲音變小，一對需要重新嚙合的齒輪轉速基本相等時，再次踩下離合器踏板，就能輕松掛入高一級檔位。

減檔時，按照“踩（離合器）、摘（空檔）、抬（離合器）、轟（油門）、踩（離合器）、掛（低速檔）”的原則。踩兩腳離合器，并在第一腳離合器后轟一腳空油，然后踩下第二腳離合器踏板，同時將變速桿變換到低速檔。這是因為要提高低檔位齒輪的轉速，使其與輸出軸轉速接近，從而順利換擋。

比如在上坡加檔時，要比平路加檔沖車時間長、動力大，避免沖車不足導致動力不足拖檔。下坡加檔分陡坡、緩坡和制動加檔三種情況。陡坡加檔不用沖車，直接換入高一級檔位；緩坡加檔可小油門短暫沖車；制動加檔要控制車速再踩兩腳離合加檔。

現在的汽車雖有同步器，理論上可不使用兩腳離合，但實際操作中，減檔用兩腳離合能延長同步齒輪環壽命、減小換檔齒輪撞擊聲，尤其運行中 2 檔轉換 1 檔必須用。