冷凝器清洗除垢需要用到不少特殊工具。

首先是牙刷或刷子，用于刷洗冷凝器表面的污垢。

還有水槍和水管及水管接口，能提供強力的沖洗水流。

改錐可用來拆卸冷凝器的相關部件。

像軟軸洗管器（通炮機）對制冷卻管的冷凝器進行除垢效果不錯，適用于立式殼管式冷凝器。

電子磁水器能在不影響制冷系統正常運轉的情況下除垢和預防結垢。

對于汽車冷凝器清洗，還會用到汽車冷凝器清洗工具，像汽車水箱免拆清洗工具，大貨車冷凝器散熱器水氣兩清洗桿等。

另外，有專門的空調翅片梳，如不銹鋼、塑料材質的，能梳理冷凝器翅片。

化學清洗時，需要用到酸洗緩蝕劑、固體的酸洗清洗劑、中和鈍化劑等藥劑。

還有像清洗機這類工具，其除垢原理和軟軸洗管器類似。