本田 S2000 的二手市場價格波動較大。

在國內，由于未正式引入售賣，能掛牌上路的極其稀少，車況好、手續齊全的價格很高，如 2006 年上牌的能賣到 89 萬左右。

在國外，比如美國，超低公里數且車況極佳的能拍出高價。像總里程僅有 34 英里的預估價值 12.5 至 15 萬美元。S2000 CR 版本在美國市場僅售出 699 臺，加上超低里程能創出高價，比如最終成交價格高達 20 萬美元。

本田 S2000 二手車價格高主要是因為其本身性能出色。它搭載 2.0L DOHC VTEC F20C 直列四缸發動機，最大功率 240 馬力，扭矩 212 牛·米，縱置前中置后輪驅動布局，搭配六前速手動變速、托森差速器和精心調校的前后雙搖臂懸架系統，操控性能極佳。

另外車源稀缺也是重要原因。國內現有的 S2000 現車分正規上牌和不能上路兩種，兩者差價達 8 至 10 倍。無正規手續不能上路的價格在 10 至 16 萬元左右，很多人買來用作收藏或打造成賽道利器。

總之，本田 S2000 二手市場價格受性能、車源、版本、里程、車況等多種因素影響。