新能源公交車價格通常比傳統公交車高。

在國內，8 米、9 米級的燃油城市公交車，帶空調暖氣和手動變速箱的價格大約在 30 萬左右；10 米、11 米級的大約在 40 萬左右；12 米級增加了自動變速箱、氣囊避震，價格能達到 60 萬左右，部分高配車型接近 100 萬。18 米以上的鉸接車一般在 150 萬以上，部分高配車型超過 200 萬。

而新能源公交車方面，8 米長的價格一般在 70-80 萬元，10 - 12 米或以上的則需要上百萬甚至幾百萬元。像南京溧水的新能源公交車均價比傳統公交車貴 10 萬元左右。

新能源公交車價格高的主要原因是搭載了成本高昂的大容量動力電池包。

不過，公交集團還是愿意購置新能源公交車，因為其能節能減排，改善廢氣排放問題。而且運營成本低，充電費用比油費劃算，保養成本也低。在公交網絡完善的情況下，補能慢的缺點能被掩蓋。

雖然電動公交續航有限，但很多車企推出了插電混動或氫燃料新能源大巴車，既滿足長續航需求，又能節能減排。預計到 2030 年，電動公交車的價格將降至與柴油公交車相當，并且電動公交車能減少 81 - 83%的維護和運營成本。