在二手車交易中，以下費用是可以協商的。

首先是過戶費，其多少取決于車子的排量大小，有的城市不收取。通常按車輛評估價的 5‰收取，可由買賣雙方商量。

其次是上牌費，一般由車管所收取，價格在 100 元到 200 元左右，能協商。

還有車船使用稅，按車輛排量或車船噸位計算，每年大概 360 元，也能協商。

交強險費用是必須繳納的，依據汽車座位數而定，雖不能協商費用，但可協商由誰承擔。

商業保險費用屬于可選，車主可根據自身需求購買，費用承擔可協商。

另外像評估費、驗車費等其他費用，具體金額能協商確定。臨牌費約 50 元，辦理新行駛證約 300 元，這些也能協商。

總之，在二手車交易中，過戶費、上牌費、車船使用稅、交強險費用、商業保險費用以及其他相關費用，如評估費、驗車費、臨牌費、新行駛證辦理費等，買賣雙方都可以通過充分溝通，根據自身情況和意愿協商確定費用的承擔方和具體金額，從而保障交易的公平與順利。