雙缸發動機在摩托車上應用廣泛。

從較小排量到公升級，都能看到它的身影。不同車型上有不同排列方式，比如直列雙缸的川崎忍者 400、V 型雙缸的鈴木 DL650、對置雙缸的寶馬 1250、以及縱置曲軸的橫置 V 缸摩托古茲 V85TT 等。

雙缸發動機相比單缸，震動更小、轉速更高、聲浪更好聽，但低扭不如單缸強，體積和油耗也不占優勢。

雙缸發動機運用范圍極寬，從小排量到大排量、運動車型到巡航車型都很常見，是一種效率高且平衡良好的發動機配置。排氣音有個性，比如“咚叩咚叩咚叩”以及不等間隔的“咚嚕嚕嚕”。

最近并列雙缸發動機流行的 270 度曲軸能達到 V 型雙缸發動機的鼓動感，并提高牽引力。直列式發動機能實現低重心，在左右傾斜時更輕盈，不過開油門時車體會有傾斜傾向。代表車型以 V 型雙缸發動機來說有 Ducati 旗下摩托車與 V-Strom 系列，并列雙缸發動機有新款 Africa Twin 以及 MT-07 等。

雙缸發動機的排布形式多樣，如哈雷的 V 型雙缸、寶馬的水平對置雙缸、杜卡迪的 L2 雙缸、日系車的并列雙缸等。其中本田的雙缸發動機在燃油經濟性、動力匹配和重量上表現均衡，其 PGM-Fi 電噴系統也很出色。

總之，雙缸發動機在摩托車領域應用廣泛，各具特點，能滿足不同需求。