藍牌車和黃牌車在以下幾個方面存在區別：限行區域、高速收費、營運證辦理、駕照要求以及保險費用。

具體如下：

1、限行區域不同：

藍牌車可以辦理入城證，駕駛人持C1及以上駕照可以駕駛。黃牌車一般不能進城，駕駛人必須持B照及以上駕駛證才可以駕駛。

2、高速收費標準不同：

在高速公路收費方面，藍牌車收費偏低，黃牌車收費一般較高。黃牌車的體積、重量等因素都是費用相對提高的原因。

3、營運證辦理情況不同：

藍牌車不需要辦理營運證，黃牌車一定要辦理營運證，同時客運與貨運的辦理條件也不一樣。

4、駕照要求不同：

黃牌車需要B級駕照才能開，藍牌車只需要C級駕照。

5、保險費不同：

藍牌車保險相對便宜，黃牌車每年的保險費用要貴一些。