兩把車鑰匙都丟了，在4S店和汽修店配鑰匙價格差異大，主要是因成本、配件及技術等因素不同。4S店使用原廠配件，有品牌和服務保障，專業性強、技術先進，匹配更完美，但成本較高；汽修店可能采用非原廠配件，價格更為親民，但在復雜或高端車型上可能存在技術和配件質量風險。不同車型、所在地區等因素，也會導致價格差異。

從成本角度來看，4S店的運營成本較高，包含品牌授權費用、場地租賃、人員培訓等多項開支。這些成本都會分攤到配鑰匙的服務價格中，所以其收費自然不低。比如普通車型在4S店配鑰匙可能就要700 - 1000元。而汽修店運營成本相對較低，沒有諸多繁雜費用，價格也就更為實惠，常見家用車型在汽修店配鑰匙幾百元即可。

配件方面，4S店使用的是原廠配件，在品質和匹配度上有絕對保障。原廠配件經過嚴格測試和質量把控，能與車輛完美適配，后期使用穩定可靠。汽修店為降低成本，可能采用非原廠配件，質量參差不齊，有的可能是高仿貨，像副廠鑰匙殼就容易出現掉漆、失靈等情況。

技術層面，4S店專業性強、技術先進，有專業的設備和經過廠家培訓的技術人員，對于車輛的各種系統更為熟悉，匹配也更完美。不過，其配鑰匙流程繁瑣，周期較長，像邁騰可能要30天左右將芯片數據導入德國總部。汽修店雖然技術手段多樣，但對于復雜或高端車型，可能存在解碼匹配不準確等風險，不過好在效率高，短則半小時就能完成。

總之，4S店和汽修店在配鑰匙價格上的差異，是多種因素共同作用的結果。車主在選擇時，要綜合考慮自身需求、車輛情況等因素，權衡利弊后做出適合自己的選擇 。