4S店和普通汽修店汽車配鑰匙價格差異大，主要在于4S店需將車架號等信息發給汽車總部，流程復雜成本高，且能保障安全性和質量，而普通汽修店流程簡單，匹配速度快但質量參差不齊，還可能有安全隱患。4S店為保障車輛安全性，會取消舊鑰匙編碼使其失效，且質量更靠譜；普通汽修店可能只是復制密碼，舊鑰匙仍能啟動車輛，還有可能提供高仿貨。所以價格自然有所不同。

從成本角度來看，4S店的運營成本較高。它不僅有著寬敞明亮的展廳、專業的銷售人員和售后團隊，其維修設備也是按照汽車品牌的標準配置，極為精良。在配鑰匙時，要嚴格遵循總部的規范流程，需要投入大量人力、物力。而且，4S店的配件都直接從廠家采購，有嚴格的質量把控，這無疑也增加了成本，這些費用最終都會體現在配鑰匙的價格上。

普通汽修店則不然，它們的運營成本相對較低。店鋪規模通常較小，人員配置也沒那么復雜，設備大多能滿足基本維修需求即可。在配件采購方面，渠道多樣，有些配件質量難以保證，甚至會使用價格低廉的高仿品來降低成本，所以能給出相對較低的價格。

從技術層面講，4S店的技術人員經過汽車廠家專業培訓，對該品牌車型的技術特點、防盜系統等了如指掌，在配鑰匙過程中能精準操作，確保新鑰匙與車輛完美匹配，并且保證車輛的安全性不受影響。而普通汽修店的技術水平參差不齊，一些維修人員可能只是掌握了基本的配鑰匙技能，對于復雜的防盜系統和車輛技術，難以做到像4S店那樣專業，這也導致價格上存在差異 。

綜上所述，4S店和普通汽修店在汽車配鑰匙價格上的差異，是由多方面因素造成的。車主在選擇時，應根據自身對價格、安全性、質量等方面的需求，綜合考量后做出合適的決定。