林肯導航員的保值率處于中等偏上水平。前五年平均保值率分別約為 71%、62.4%、57.4%、52.7%、45.2%，在大型 SUV 中排第 10 名。

不同城市的保值率存在差異，像北京市 1 年保值率為 73.9%，5 年為 47.1%；深圳市 1 年保值率達 72.6%，5 年為 46.3%。

影響其保值率的因素有不少。比如林肯品牌在國內市場占有率不高，影響力比主流豪華品牌弱。它是大型全尺寸 SUV，油耗高，使用成本大。車輛的關稅計算方式按發動機排量，負擔較重。林肯領航員用的福特 Ecoboost 3.5T 渦輪增壓引擎，與寶馬 750 的 4.0T、奧迪 A8 4.0T 版本比不占優，定價與產品力不太匹配。美系豪華車在國內銷量相對低，領航員二手市場供大于求，價格受壓制，維護成本也高。

不過林肯領航員也有保值的優勢，外觀大氣豪華辨識度高，車內空間寬敞配置豐富舒適性好，動力上 3.5T V6 雙渦輪增壓發動機配 10 速自動變速箱性能優秀。

如果考慮購買林肯領航員，建議做好長期使用的準備，或者在購買新車時爭取較大優惠降低未來車輛貶值帶來的損失。同時要注意車輛的車況、里程數、使用情況等，如果車況良好、里程數低且保養得當，保值率會相對較高，還需綜合考慮車輛的手續是否齊全以及市場行情的變化。